Jaap Boots groeide op in kunstenaarsdorp Bergen (NH) en belandde na zijn middelbare schooltijd in de jaren ’80 op de UvA voor een studie Nederlandse Taal & Letterkunde. Met kompanen als Jan Kostwinder, Marisa Groen, Hein Aalders, Hans Kloos en Rogi Wieg zette hij zijn eerste stappen in literatuur en poëzie (Adem, De Held), en werkte daarna als journalist en recensent (Vrij Nederland, HP/DeTijd, Vogue, Groene Amsterdammer).Uiteindelijk vond hij zijn bestemming bij de VPRO, waar hij tussen 1988 en 2014 vele radio- en tv-programma’s bedacht, samenstelde en presenteerde. Samen met Bram Van Splunteren, Fons Dellen, Lotje IJzermans, Jan Donkers, Roel Bentz vanden Berg, Job De Wit, Erwin Blom, Leonieke Daalder en vele anderen vormde hij jarenlang het 'VPRO 3FM Hit-Team' dat een hele generatie aan de betere popmuziek bracht.
Al die tijd bleef Boots naast presenteren ook zingen, schrijven, vertellen, optreden en albums opnemen. 
Tot besluit van zijn wilde VPRO-jaren schreef Boots in 2014 zijn DJ-memoires op in de verhalenbundel Donderweg, volgens Leo Blokhuis (en vele andere lezers) 'een heerlijk boek' en ging daarna mediageschiedenis en radio doceren aan de Hogeschool van Amsterdam. In 2022 verscheen zijn veelgeprezen eerste (rock)dichtbundel Bambalam, geïllustreerd door Erik Kriek (inmiddels tweede druk).
Sinds 2024 doceert Boots het vak Pop History aan het Conservatorium van Amsterdam. In dat jaar verscheen ook zijn vierde album Wilde Tulpen. Dit album werd (net als voorgangers Zal De Hemel, Afkuil en Terug Naar Zee) onthaald met lovende kritieken. Op dit moment toert Jaap door het land met zijn 'one man man rock 'n roll- theatershows' om zijn releases te ondersteunen.